Llevaba bastante tiempo buscando como ver correctamente los acentos y demás caracteres con samba y al fin he encontrado la solución. y bastante sencilla:

solo hay que añadir la opción "iocharset=utf8" y "codepage=cp850"

Se asume la siguiente situación
IP del equipo en Red: 192.168.0.1
Nombre de la Carpeta compartida: linux
Carpeta local donde montarla: /media/sharename

- si montamos la partición manualmente:

$ sudo mount //192.168.0.1/linux /media/sharename/ -o iocharset=utf8,codepage=cp850,dmask=777,fmask=777

- si lo hacemos al inicio:

$sudo vi /etc/fstab

//192.168.0.1/linux /media/sharename smbfs iocharset=utf8,codepage=cp850,dmask=777,fmask=777 0 0