8.04 Web y Correo dejan de funcionar

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Hola quisiera me pudieran ayudar con un problema.

Tengo montado un servidor web (php5 - Apache2 - bind9) y un servidor de correo (postfix - dovecot - amavis) .
El servidor funciona desde hace un par de años, pero cada año una o dos veces, de la nada el servidor de correo deja de funcionar reinicio los servicios y no da ningun problema reinicio el servidor y nada salvo que presenta que existen actualizaciones pendientes.

¿Es posible que por falta de actualizar el servidor algunos servicios dejen de funcionar?

Al ver que no hay ningun problema presente en el servidor procedo a actualizar los paquetes pendientes. Al actualizar el servidor de correo empieza a dar diferentes fallos al revisar el "main.cf" veo que ciertas lineas ya no existen como las de "mynetworks, entre otras", con un archivo backup arreglo el "main.cf" y todo vuelve a la normalidad.

¿Es posible que por actualizar el servidor los archivos de configuración se modifiquen?

Este problema se me repite casi una ves al año y solo asi lo arreglo y en esta ultima ocación se modifico el apache2.conf.

Gracias...