Modificacion en windows afecta ubuntu?

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Hola, bueno les comento. Una vez que instale ubuntu junto con windows al tiempo de no haber entrado en windows advierto que este estaba infectado... no me deja navegar aunque tenga internet y bueno... asi con otros programas.
Trate de desinfectarla desde ubuntu pero los errores no se solucionaron.
Mi intencion ahora era la de utilizar esa cualidad de windows de volver el sistema a un punto anterior, pero mi miedo es que justamente ese punto es antes de la instalacion de ubuntu, y quisiera saber si esa opcion me modificaria la particion de ubuntu tambien.
Gracias!

Imagen de cuentos
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depende de como intalaste ubuntu, en una particion aparte o con wubi, si fue en particion aparte no te afecta nada, con wubi, nunca lo instalo por que se convierte en un programa mas de win con los problemas de win.

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