Acerca del programa LAMMPS

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Soy principiante acerca del uso de este tipo de programas para realizar simulaciones. En verdad busqué información en la web y lo que encuentro no es para un nivel inicial. Este programa cuenta con una serie de archivos en particular con una carpeta en donde se encuentran los ejemplos para simular, la idea es hacer correr esos ejemplos, pero no sé como ir abriendo las distintas carpetas dado que desconozco cuál es la sintaxis adecuada para realizarlo.
Cuento con los comandos básicos y sé que significan, pero a la hora de cargarlos a la terminal evidentemente no los utilizo adecuadamente. Desde ya si alguien puede brindarme una ayuda acerca de como usar adecuadamente este programa se lo agradecería enormemente!!

Imagen de cuentos
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como no se mucho de esto, pero checa si es lo que buscas:
http://www.ehu.es/sgi/software/lammps-2

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(recordatorio) -+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-
Si el problema se soluciono, edita el 1° hilo, y agrega (Solucionado), para tener el foro mas ordenado.
Y finaliza poniendo la solución para que sirva para otros Usuarios.
Twitter @mcuentos

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la idea es hacer correr esos ejemplos, pero no sé como ir abriendo las distintas carpetas dado que desconozco cuál es la sintaxis adecuada para realizarlo.

Es lógico que lo desconozcas, por eso escribieron un manual.
http://lammps.sandia.gov/doc/Section_start.html#start_6

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