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yo creo que es indiferente, pero es mejor que 'mande' el grub de Ubuntu por lo que sería bueno que, si instalas primero Ubuntu, al final lo arranques y reinstales su Grub.

Varios matices importantes: primero, que te va a convenir crear una partición extendida. Segundo, que con una partición swap te vale (para ambos). Tercero, que no se si knoppix usa el grub 1 (legacy). en cuyo caso, como Ubuntu usa el grub 2, quizás te convenga, instalando primero Ubuntu, al instalar Knoppix indicar que NO instale su grub (y hacer un sudo update-grub, etc, para que Ubuntu lo reconozca).

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