Pérdida de archivos al actualizar con el gestor dse actualizaciones

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No hace mucho hice una instalación en limpio de Ubuntu 12.04 y quedé contento.
Al poco apareció el gestor de actualizaciones informando que había varias. Yo como siempre, le di a instalar todas..
Hoy he vuelto a instalar varias actualizaciones.
El caso es que al reiniciar me encuentro con que el fondo de escritorio no es el que tenía, ni encuentro los archivos que tenía en el escritorio, ni las últimas imágenes de fondos guardadas en imagenes.
La primera vez lo achaqué a mis hijos, pero ellos tienen una cuenta aparte.
Hoy me ha molestado muchísimo, porque los últimos archivos me ha desaparecido.
Alguien me puede dar una explicación.

Llevo usando ubuntu, a nivel de usuario desde la versión 7.04, y es la primera vez que me pasa (bueno, 2 veces con esta versión).
Es como si se restaurara a un momento anterior.

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Es rarísimo.
He reiniciado varias veces y en algunas ocasiones me inicia con el escritorio anterior a la pérdida de archivos, y en otras ocasiones con el posterior. Además, firefox no consigue conectarse a ninguna página.

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