Error grafico gnome y unity se mezclan ambos entornos

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He estado provando los efectos de compiz icon , e instalado Emerald theme manager , se han aplicado los cambios y al reiniciar el sistema , se han combinado de manera muy extraña el entorno de gnome y Unity , solamente al iniciar gnome clasico , no me pasa con gnome shell y tampoco si inicio desde Unity, solo me pasa al iniciar desde gnome clasico.
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He buscado por la red , al parecer era un problema del nautilus, he desactivado "Have file manager handle the desktop", y nada ha ocurrido.
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Tambien he desinstalado los paquetes (desde synaptic)"appmenu-gtk" y "appmenu-gtk3"
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Desde ya muchas Gracias, soy nuevo en Linux, y la verdad que me parece genial ! me gustaria un poco de soporte para problemas de este tipo , pero me encanta todo lo que se encuentra en los foros y la comunidad.