Como estaba hasta las narices de compiz y los problemas que me daba con ATI y los dos monitores, he probado openbox y de momento usando los paneles de gnome para el systray y las ventanas. Me he quedado encantado con el gestor de ventanas pero tengo un problema que también me pasó cuando probé enlightenment.
Si intento ejecutar synaptic o el centro de software, me dan errores. Synaptic directamente no abre y tengo que ejecutarlo por terminal, y el centro de software si abre, pero tanto si lo hago a través del menú como de la terminal, el programa se abre y cuando intento instalar cualquier cosa salta
"No se puede instalar o eliminar software porque el servicio de autenticación no está disponible. (org.freedesktop.PolicyKit.Error.Failed: ('system-bus-name', {'name': ':1.510'}): org.debian.apt.install-or-remove-packages"
No entiendo ese error. ¿necesito cargar algún módulo/servicio de gnome? ¿o es independiente? Uso Ubuntu 12.10 y no desinstalé nada de gnome ni unity.

Synaptic seguramente abrirá
Synaptic seguramente abrirá también con un lanzador si le asignas el comando gksu nautilus.
Lo del centro de software y el servicio de policikit ni idea.
PD. Fe de erratas: naturalmente es gksu synaptic.