Problema con gráficos de todo tipo

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Hola a todos:
La verdad que soy un poco nuevo en el uso de Linux, y no tengo mucha idea. El caso es que me he encontardo que muchos programas básicos de dibujos de gráficas y cosas así, no funcionan (como por ejemplo: Avogadro ó el Standard draw). El problema que solo visualizo una ventana en blanco, en la que no puedo modificar nada.

Gracias por vuestra ayuda