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básicamente, a partir de una distro 'minimal' tendrías que instalar, o ver si están instalados
- el servidor X ('# apt-get xserver.xorg...' etc)
- los controladores de video y el soporte 3D
- el GDM (Grafic Display Manager, o Gestor de Pantalla)
- quizás alguna fuente
- el entorno gráfico
y luego ya, efectivamente, las aplicaciones y utilidades que quieras tener instaladas.

Si te gusta el tema, adelante, tendrás que estudiarte un poco las cosas. Y si quieres aprender a fondo, pásate por ArchLinux. La verdad, es mucho más cómodo partir de una distro ya preparada, con el entorno gráfico que más te guste, y donde solo tengas que añadir las aplicaciones y utilidades que te apetezca tener... (esto lo ves muy claro si te pones a crear una distro con ArchLinux (que es una gran escuela de aprendizaje), y luego descubres distros como Manjaro, Cinnarch, etc... que te lo facilitan bastante.

Vamos, que es (en mi opinión) lo que pasó, en tiempos iniciales, con Debian y Ubuntu

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