Problema con 2 monitores

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Nau
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Saludos. :)

Mi problema es el siguiente. Utilizo Ubuntu 12.10 con dos monitores, el portátil y otro. Uso como monitor principal el monitor alternativo. Al ejecutar cualquier aplicación esta se lanza en el monitor principal pero en el momento en que intento interactuár con dicha aplicación (Cualquier aplicación) esta se lanza directamente al monitor secundario. Esto me obliga a ir al monitor secundario para arrastrar la ventana hasta el principal.

No sería mayor problema si esto sucediera solo con una aplicación. Pero claro es con todo. Le he estado dando vueltas y buscando en las opciones de configuración, incluso en el Tweak Tool y sigo sin resultado. He buscado en google por si alguien tuviera este mismo problema pero nada.

Si por favor algún alma caritativa me echara un cable se lo agradecería brutalmente dado el hecho de que estoy hasta las mismisimas de dar vueltas. :P

Igualmente muchas gracias y de nuevo Saludos a todos. :D