Intalar ubuntu segundo HD (1 con Win7)

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Hola buenas noches,

Escribo porque creo que me voy a dar por vencido. En mis macintosh tengo Ubuntu y MacOS conviviendo muy apaciblemente, y utilizando como inicio rEFIt, vamos, todo perfecto.

Recientemente necesito instalar en un PC Ubuntu en un segundo disco duro que puse. SATA. (Este estaría como esclavo, como secundario y además esta vacio. El primero contiene la instalación de Windows 7. ¿Como debería instalar Ubuntu en el segundo disco? ¿Donde debería ir el Grub? Mi intención es que Ubuntu quede completamente separado de windows, de echo el ordenador es prestado y no quiero correr ni el minimo riesgo de borrar ni un solo archivo de windows o crear un problema, por lo que no me importaría que cada vez que iniciara el ordenador tuviera que pulsar F8 para seleccionar mi disco.

Una de las cosas que me parecen extrañas es que al pulsar F8 me aparecen los dos discos, (uno de ellos esta vacio que es donde iria Linux) pero al seleccionarlo como arranque debería de dar error porque no hay nada, si embargo, arranca windows 7 normalmente, ¿como puede ser esto? ¿como me aconsejáis que instale Ubuntu?

Muchas gracias por la ayuda.