Dudas con el GRUB de ubuntu y el inicio de Windows (Solucionado)

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Buen Día comunidad,
Soy muy nuevo con linux así que disculpen cierta ignorancia.
Les paso a plantear mi problema, mi PC tiene un disco de 500 GB y otro de 100 GB, en el de 500 tengo windows 7 con todos mis documentos y archivos y en el de 100 puse ubuntu 12.04 como para empezar a conocer el mundo linux, cuando puse ubuntu en el de 100 había desconectado el de 500 y instale ubuntu directamente. Luego para iniciar ubuntu o windows presionaba en el inicio F11 para seleccionar con cual disco bootear y de hay elegía el de 500 o el de 100. Hasta hay bárbaro ya que no usaba el GRUB para seleccionar el SO sino que lo hacia directamente seleccionando el disco, con esto lograba una independencia total de los dos sistemas.
Resulta que el disco de 100 me estuvo tirando ciertos errores por fallos del propio disco, baje la herramienta de reparación del propio disco y aparentemente lo reparo, (pero ya no me parece un disco confiable). La cuestión que cuando salio Ubuntu 13.04 me lo descargue para actualizarlo y de vago lo actualize sin desconectar el disco de 500(Windows7). Ahora lo que paso es que se me ha modificado el MBR de Windows y si booteo seleccionando el disco me tira un error, pero si la dejo iniciar normal aparece el GRUB y de ay puedo seleccionar windows y arranca perfecto. Ustedes dirán cual es el problema?? ya que el GRUB esta bueno para seleccionar el SO), pero mi miedo es que si se me rompe el disco de 100 no voy a poder iniciar Windows, que es donde realmente tengo todos mis documentos.
Se podría volver a poner como estaba para que me queden independientes??
Disculpen si hice demasiado largo el relato pero no sabia como sintetizarlo mas

Les agradezco de antemano su respuesta.

Saludos

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tienes que buscarlo en internet, reinstalar mbr en windows 7,
Y como veras se sale de los temas del foro, pero mas o menos busca y encuantras algo como eso:
http://www.ehowenespanol.com/reparar-mbr-windows-7-como_45285/
Nota, puedes dejar el grub, y cuando te falle el disco duro de ubuntu, ya puedes a proceder a recuperar el MBR.

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(recordatorio) -+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-+-
Si el problema se soluciono, edita el 1° hilo, y agrega (Solucionado), para tener el foro mas ordenado.
Y finaliza poniendo la solución para que sirva para otros Usuarios.
Twitter @mcuentos

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Hola cuentos, te agradezco por tu pronta respuesta. Realmente tenia miedo de meter la pata por eso necesitaba la respuesta de alguien que este en el tema. Voy a hacer lo que decís lo voy a dejar hasta que me falle.
Un abrazo, y muchas gracias

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