La carpeta y sub carpeta de apache2 salen vacías

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Saludos, soy nuevo por acá y quisiera que me ayuden con un problemita que tengo.
Hace poco instalé el Apache2 para aprender sobre esta cuestión de servidores virtuales, la cosa es que a la hora de configurar lo hice mal y no guarde una copia de seguridad, entonces opté por desinstalarlo desde la consola tipeando sudo apt-get remove --purge apache2. Cuando estaba en el proceso de desinstalación me salió un mensaje diciendome que unos archivos no se eliminaron que para hacerlo usara sudo apt-get autoremove y así lo hice.
Cuando todo el proceso acabó volví a instalar apache2 pero ahora la carpeta y sub carpetas de apache2 aparecen vacías, no sé que tengo que hacer para que el apache se instale correctamente.

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Gracias por el aporte esta muy bien detallado, pero el problema es cuando se instala el apache2, por ejemplo cuando se instala apache este se guarda en la carpeta etc [/etc/apache2], dentro de la carpeta apache2 hay unas subcarpetas y otros archivos, tales como el apache2.conf o el default.
Cuando yo lo volví a instalar ya estos archivos no aparecen y las subcarpetas aparecen vacías, no sé si hay una forma de que estos archivos vuelvan a aparecer
P.D Ya he intentado desde el Centro de Software y nada, sigue igual.

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