Linux en dominio Windows

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Hola amigos,

Tengo algunas consultas que quisiera me puedan ayudar. En mi trabajo se esta mirando la posibilidad de migrar a linux, la cuestión es que actualmente se trabaja con dos controladores de dominio administrados desde un Windows Server 2003, y se aplican diversas políticas de grupo para varios usuarios como por ejemplo:

Mapeo automático de carpetas (públicas y privadas) al conectarse en cualquier equipo dentro del dominio, ésto se logra ejecutando un bachero cada ves que un usuario inicia sesión, de acuerdo a las políticas establecidas en el dominio.

Ahora en linux, he logrado ingresar a dominio una PC con Ubuntu 12.04 LTS utilizando centrifydc y no hay ningún problema, además también he configurado el proxy y no tengo problema alguno, el problema que tengo es para poder mapear automaticamente las carpetas que tienen los bacheros antes mencionados, se que lo puedo hacer con samba pero es para un determinado usuario, sin embargo en una PC ingresan varios usuarios y cada uno tiene una carpeta específica y varias compartidas, ¿Cómo puedo lograr para que se mapeen automaticamente las carpetas al iniciar sesión un usuario del dominio?

Desde ya muchas gracias por el apoyo que puedan brindarme.