Imagen de runsaber
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Gracias Goyo, usando parte de lo que me dijiste, y parte de lo leído por aquí y por allá, llegué al sitio donde están los repos de initramfs-tools y initramfs-tools-bin. Es aquí: http://security.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/i/initramfs-tools/ , y además dejo la explicación completa, pues a alguien le puede servir:
El tema es que no existe no sé por qué motivo la versión que me solicitaba (y por eso daba error). La versión 0.99ubuntu13.1 no existe... entonces qué hacer?, probar!. Hice un downgrade con la versión anterior a la que me solicitaba ( o sea, 0.99ubuntu13 ), lo descargué: sudo curl -O http://security.ubuntu.com/ubuntu/pool/main/i/initramfs-tools/initramfs-tools-bin_0.99ubuntu13_i386.deb , y después lo configuré:

sudo dpkg -i initramfs-tools-bin_0.99ubuntu13_i386.deb
dpkg: aviso: desactualizando initramfs-tools-bin de 0.99ubuntu13.2 a 0.99ubuntu13.
(Leyendo la base de datos ... 148199 ficheros o directorios instalados actualmente.)
Preparando para reemplazar initramfs-tools-bin 0.99ubuntu13.2 (usando initramfs-tools-bin_0.99ubuntu13_i386.deb) ...
Desempaquetando el reemplazo de initramfs-tools-bin ...
Configurando initramfs-tools-bin (0.99ubuntu13) ...
y hizo el downgrade sin problemas... después, para probar, el famoso sudo apt-get install -f ... e instaló la nueva versión del kernel... dejó el log:

sudo apt-get install -f
Leyendo lista de paquetes... Hecho
Creando árbol de dependencias
Leyendo la información de estado... Hecho
0 actualizados, 0 se instalarán, 0 para eliminar y 2 no actualizados.
3 no instalados del todo o eliminados.
Se utilizarán 0 B de espacio de disco adicional después de esta operación.
Configurando initramfs-tools (0.99ubuntu13) ...
update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Configurando apparmor (2.7.102-0ubuntu3.9) ...
Instalando una nueva versión del fichero de configuración /etc/apparmor.d/abstractions/ubuntu-browsers.d/ubuntu-integration ...
* Starting AppArmor profiles Skipping profile in /etc/apparmor.d/disable: usr.sbin.rsyslogd
[ OK ]
* Reloading AppArmor profiles Skipping profile in /etc/apparmor.d/disable: usr.sbin.rsyslogd
[ OK ]
Configurando udev (175-0ubuntu9.4) ...
udev stop/waiting
udev start/running, process 14361
Eliminando `desviación de /sbin/udevadm a /sbin/udevadm.upgrade por fake-udev'
update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Procesando disparadores para initramfs-tools ...
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-3.2.0-54-generic-pae
obustos@Inmobiliaria:~$ sudo apt-get install -f
Leyendo lista de paquetes... Hecho
Creando árbol de dependencias
Leyendo la información de estado... Hecho
0 actualizados, 0 se instalarán, 0 para eliminar y 2 no actualizados.
obustos@Inmobiliaria:~$ sudo apt-get upgrade
Leyendo lista de paquetes... Hecho
Creando árbol de dependencias
Leyendo la información de estado... Hecho
Se actualizarán los siguientes paquetes:
initramfs-tools initramfs-tools-bin
2 actualizados, 0 se instalarán, 0 para eliminar y 0 no actualizados.
Se necesita descargar 0 B/59,0 kB de archivos.
Se utilizarán 1.024 B de espacio de disco adicional después de esta operación.
¿Desea continuar [S/n]? S
(Leyendo la base de datos ... 148198 ficheros o directorios instalados actualmente.)
Preparando para reemplazar initramfs-tools 0.99ubuntu13 (usando .../initramfs-tools_0.99ubuntu13.2_all.deb) ...
Desempaquetando el reemplazo de initramfs-tools ...
Preparando para reemplazar initramfs-tools-bin 0.99ubuntu13 (usando .../initramfs-tools-bin_0.99ubuntu13.2_i386.deb) ...
Desempaquetando el reemplazo de initramfs-tools-bin ...
Procesando disparadores para man-db ...
Configurando initramfs-tools-bin (0.99ubuntu13.2) ...
Configurando initramfs-tools (0.99ubuntu13.2) ...
update-initramfs: deferring update (trigger activated)
Procesando disparadores para initramfs-tools ...
update-initramfs: Generating /boot/initrd.img-3.2.0-54-generic-pae

Repetí el proceso para ver si estaba todo correctamente actualizado

sudo apt-get upgrade
Leyendo lista de paquetes... Hecho
Creando árbol de dependencias
Leyendo la información de estado... Hecho
0 actualizados, 0 se instalarán, 0 para eliminar y 0 no actualizados.

Todos los paquetes actualizados al día!, nuevamente, gracias Goyo por darme luces de lo que podía hacer y por las prontas respuestas. ;-)

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Imagen de Goyo
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Me parece que es un error de empaquetado que probablemente se solucionará pronto. Si te corre prisa actualizar o instalar algún programa intenta esto:
sudo apt-get install initramfs-tools-bin=0.99ubuntu13 initramfs-tools=0.99ubuntu13

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