No indicas qué programa utilizas para la red eDonkey.

Según el programa que utilices podrías utilizar una extensión que se llama MLDonkey protocol handler.
O seguir las instrucciones de esta web:
http://mldonkey.sourceforge.net/Browser_Integration
modificándolas si fuera necesario para el programa que uses.
Un saludo.

Firefox, aMule y los enlaces Ed2k etiquetado como: amule, Ed2k, Firefox, Linux y Tutorial

aMule es uno de los programas más utilizados en Linux para gestionar las descargas y subidas a la red de Edonkey. La primera vez que use este programa y Firefox al mismo tiempo me dí cuenta de que Firefox no sabe que hacer con los enlaces ed2k://, esto es, que una vez que hemos clickeado en un enlace ed2k, Firefox no envía la información a aMule y por tanto no se empieza a descargar el archivo que hay tras el enlace. Para que Firefox envie a aMule los enlaces de tipo ed2k://, tenemos que seguir los siguientes pasos:

Asegurate que tienes instalado el paquete amule-utils, sino es así, ve a Sistema - Administración - Gestor de paquetes Synaptic, y buscas el paquete amule-utils y procedes a su instalación. A continuación introduce s en la barra de direcciones de Linux el comando about:config. En la ventana que se abre pulsas el botón derecho del ratón y en la lista que aparece seleccionas Nuevo – Lógico, introduce network.protocol-handler.external.ed2k en la ventana que aparece y como valor introduces true. Ahora nuevamente le damos al botón derecho del ratón y seleccionamos Nuevo – Cadena, en la que introducimos primeramente network.protocol-handler.app.ed2k y cuando nos pida el valor introducimos /usr/bin/ed2k.

Ahora cada vez que pinches en un enlace de edk2 en Firefox se ira a la lista de descargas de aMule

de la web: http://www.propiedadpublica.com/blog/index.php?tag=firefox

A mi me ha funcionado muy bien