Servicio Web con NetBeans

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He buscado bastante en internet y no me queda claro. Quero realizar un servicio web en java, para esto supuestamente necesito tomcat que es supuestamente lo que permite correr por si solo la aplicacion o en conjunto con apache. Desde NetBeans he intentado hacer funcionar un ejemplo (calculadora) para ver como funciona pero me pide configurar un servidor (supongo que tomcat). Elijo tomcat 5.5 y al momento de optar por un directorio (catalina) me dice que no es valido, no pudiendo seguir con el asistente. Tengo tomcat en NetBeans hata la version 6 y NetBeans instalado en Ubuntu junto con Apache aunque no se como funciona. Necesitaría una guia clara al repecto sobre todo esto. Muchas gracias