Mas de 255 caracteres?

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Hola, muy buenas.

 Me estoy pasando a Linux (ubuntu), esto es que soy novato por ahora claro.

Mi cuestion es: Estoy pasando todo lo habido y por haber desde Windows (NTFS) a Linux, en Win tengo rutas muy muy largas y nombres muy muy largos de archivos que no puedo cambiar, necesito la gerarquia de todos los directorios, entonces, cuando lo paso a Linux, o se me queda bloqueado, o no los puedo luego borrar, vamos, que Linux no se traga mas de 255 caracteres.

 No hay manera de solucionar este problema? Supongo que este problema lo deben tener grandes empresas con un arbol de directorios extendido y con muchos usuarios, digo yo¿?¿?

 Muchas gracias por leerme.