Gnome lento sin sentido

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Hola amigos, os pongo en situación. Tengo un portátil Acer Aspire con doble núcleo y una tarjeta nvidia. Pues bien tenía Ubuntu perfectamente andando (8.04) hasta que se me ocurrió hacer una partición a parte para /Var, que luego la volví a quitar porque no le veo ventajas, ya que cada vez que reinstalo Ubuntu me obliga a formatearla. Pero bueno cuando inicio sesión hay muchas aplicaciones que tardan una barbaridad en arrancar (recién instalado Ubuntu), sin embargo cuando reinicio las X ya va todo rápido...:( Yo creo que es problema de Gnome, ¿qué puede ser?

Gracias